O ICF tem suas atividades executadas em duas unidades: Clínica/Administrativa e Analítica/Estatística. 

A Unidade Clínica e Administrativa do ICF está instalada em uma área com mais de 2.000 m2 dedicados ao recrutamento, atendimento clínico e internação de voluntários; às atividades administrativas e às operações comerciais. Consultórios médicos, 56 leitos, farmácia, sala de randomização de medicamentos com capela de fluxo laminar e balança analítica, sala de primeiros socorros, laboratório de separação de amostras biológicas, área exclusiva para coletas extras, UTI móvel 24 horas, auditório e as diretorias Clínica e Comercial. 
 

Na unidade Analítica e Estatística operam os laboratórios de ensaios in vitro e in vivo, os departamentos de projetos e de estatística, e as diretorias institucional e técnica do ICF. São 1.300 m² dedicados aos mais modernos equipamentos analíticos.
 

As duas unidades operam ininterruptamente garantidas por geradores elétricos e por departamentos locais de TI e de Garantia da Qualidade (responsável pela implantação dos procedimentos e treinamentos, pelo monitoramento independente de todos os estudos e ensaios realizados pelo ICF e pela execução de auditorias internas e de fornecedores, baseadas nos requisitos exigidos pelas boas práticas clínicas e laboratoriais e normas vigentes). Arquivos com detectores de fumaça e o controle de acesso garantem a segurança no armazenamento de medicamentos,